Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtp3Q5QGU6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms