Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Scarf1Q5ND28 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scarf1Q5ND28 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scarf1Q5ND28 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scarf1Q5ND28 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scarf1Q5ND28 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scarf1Q5ND28 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scarf1Q5ND28 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scarf1Q5ND28 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scarf1Q5ND28 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Scarf1Q5ND28 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms