Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rapgef6Q5NCJ1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rapgef6Q5NCJ1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rapgef6Q5NCJ1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms