Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB2

Gm12185, Predicted gene 12185, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12185Q5NCB2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm12185Q5NCB2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm12185Q5NCB2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms