Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH7

Slc38a8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a8Q5HZH7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc38a8Q5HZH7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Slc38a8Q5HZH7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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