Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnni3kQ5GIG6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tnni3kQ5GIG6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms