Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ecm2Q5FW85 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ecm2Q5FW85 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
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