Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Syce1lQ5D525 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1lQ5D525 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms