Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eme2Q56A04 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eme2Q56A04 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms