Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc84Q4VA36 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc84Q4VA36 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms