Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Afg1lQ3V384 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Afg1lQ3V384 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms