Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dnah12Q3V0Q1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Dnah12Q3V0Q1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Dnah12Q3V0Q1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Dnah12Q3V0Q1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Dnah12Q3V0Q1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Dnah12Q3V0Q1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Dnah12Q3V0Q1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dnah12Q3V0Q1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms