Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc43Q3V0L5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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