Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930567H17RikQ3V0K5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms