Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms