Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3V0E1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3V0E1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3V0E1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3V0E1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3V0E1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3V0E1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3V0E1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3V0E1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3V0E1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms