Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnaaf3Q3UYV8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms