Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate2Q3UW31 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate2Q3UW31 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate2Q3UW31 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate2Q3UW31 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate2Q3UW31 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate2Q3UW31 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate2Q3UW31 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate2Q3UW31 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate2Q3UW31 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate2Q3UW31 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pate2Q3UW31 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pate2Q3UW31 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms