Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clpsl2Q3UW21 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clpsl2Q3UW21 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms