Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chpf2Q3UU43 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chpf2Q3UU43 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms