Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BB287469Q3UT53 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BB287469Q3UT53 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BB287469Q3UT53 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BB287469Q3UT53 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BB287469Q3UT53 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BB287469Q3UT53 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BB287469Q3UT53 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms