Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Klhdc9Q3USL1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Klhdc9Q3USL1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms