Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28047Q3US59 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28047Q3US59 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms