Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
E130208F15RikQ3UPV3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
E130208F15RikQ3UPV3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms