Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q3UPC7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q3UPC7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q3UPC7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3UPC7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UPC7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UPC7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UPC7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UPC7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UPC7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UPC7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UPC7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q3UPC7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q3UPC7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms