Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Hdgfl2Q3UMU9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms