Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cobll1Q3UMF0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cobll1Q3UMF0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms