Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cog7Q3UM29 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms