Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc33Q3ULW6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc33Q3ULW6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms