Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ell2Q3UKU1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ell2Q3UKU1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ell2Q3UKU1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ell2Q3UKU1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ell2Q3UKU1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ell2Q3UKU1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ell2Q3UKU1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ell2Q3UKU1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms