Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc61Q3UJV1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc61Q3UJV1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms