Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b2Q3UJB0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b2Q3UJB0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms