Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms