Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc34Q3UI66 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc34Q3UI66 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms