Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnrc6cQ3UHC0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms