Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph3aQ3UFY4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph3aQ3UFY4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms