Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zyg11bQ3UFS0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zyg11bQ3UFS0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms