Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam35aQ3UEN2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam35aQ3UEN2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms