Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atxn7l3bQ3UD01 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atxn7l3bQ3UD01 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms