Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf180Q3U827 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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Rnf180Q3U827 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Rnf180Q3U827 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Rnf180Q3U827 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Rnf180Q3U827 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Rnf180Q3U827 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Rnf180Q3U827 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Rnf180Q3U827 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnf180Q3U827 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rnf180Q3U827 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf180Q3U827 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf180Q3U827 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf180Q3U827 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf180Q3U827 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf180Q3U827 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf180Q3U827 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf180Q3U827 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf180Q3U827 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnf180Q3U827 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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