Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ssbp4Q3U4B1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssbp4Q3U4B1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssbp4Q3U4B1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssbp4Q3U4B1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssbp4Q3U4B1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssbp4Q3U4B1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ssbp4Q3U4B1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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