Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl21Q3U410 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl21Q3U410 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms