Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms