Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vars2Q3U2A8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vars2Q3U2A8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms