Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pag1Q3U1F9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pag1Q3U1F9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms