Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc9Q3U0M1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trappc9Q3U0M1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms