Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hace1Q3U0D9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hace1Q3U0D9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms