Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Hbq1bQ3U0A6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Hbq1bQ3U0A6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Hbq1bQ3U0A6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Hbq1bQ3U0A6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hbq1bQ3U0A6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hbq1bQ3U0A6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hbq1bQ3U0A6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hbq1bQ3U0A6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hbq1bQ3U0A6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hbq1bQ3U0A6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hbq1bQ3U0A6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hbq1bQ3U0A6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms