Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccdc136Q3TVA9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Ccdc136Q3TVA9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccdc136Q3TVA9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms