Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fbxw18Q3TSA9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fbxw18Q3TSA9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms